La Faculté des Sciences de l’Université de Fayoum a été créée par le décret présidentiel No 23 en 1995, filiale de l'Université du Caire. Ensuite, le décret présidentiel n ° 84 de 2005 a été publié, concernant la création de l'Université de Fayoum et la Faculté des Sciences a devenu de l'université de Fayoum. Depuis sa création, la faculté a connu une évolution importante dans ses départements scientifiques, ses programmes d’études et ses orientations générales. La faculté a commencé, dans la première année 1995/1996, par un petit nombre de membres du corps professoral, et en 2016 le nombre de membres du corps professoral de la faculté était 160 membres et 65 des professeurs assistants et des assistants
